Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THUMPD3Q9BV44 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD3Q9BV44 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THUMPD3Q9BV44 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
THUMPD3Q9BV44 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms