Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MTA3Q9BTC8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MTA3Q9BTC8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MTA3Q9BTC8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MTA3Q9BTC8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms