Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM175Q9BSA9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM175Q9BSA9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM175Q9BSA9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM175Q9BSA9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms