Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SGIP1Q9BQI5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SGIP1Q9BQI5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
SGIP1Q9BQI5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SGIP1Q9BQI5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms