Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SELENOSQ9BQE4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SELENOSQ9BQE4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SELENOSQ9BQE4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms