Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RETNLBQ9BQ08 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms