Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA3Q99618 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA3Q99618 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA3Q99618 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDCA3Q99618 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDCA3Q99618 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA3Q99618 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDCA3Q99618 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.3 ms