Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
RMDN3Q96TC7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RMDN3Q96TC7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RMDN3Q96TC7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RMDN3Q96TC7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms