Protein–RNA interactions for Protein: Q96T58

SPEN, Msx2-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPENQ96T58 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPENQ96T58 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPENQ96T58 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPENQ96T58 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms