Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCNAQ96QF7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCNAQ96QF7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNAQ96QF7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms