Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC38A2Q96QD8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A2Q96QD8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A2Q96QD8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms