Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCEEQ96PE7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCEEQ96PE7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCEEQ96PE7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCEEQ96PE7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCEEQ96PE7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCEEQ96PE7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCEEQ96PE7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCEEQ96PE7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCEEQ96PE7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCEEQ96PE7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCEEQ96PE7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCEEQ96PE7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MCEEQ96PE7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms