Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCLT1Q96NL6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCLT1Q96NL6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCLT1Q96NL6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCLT1Q96NL6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms