Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL3

ZNF599, Zinc finger protein 599, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF599Q96NL3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF599Q96NL3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF599Q96NL3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF599Q96NL3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF599Q96NL3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms