Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RUNDC3BQ96NL0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNDC3BQ96NL0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC3BQ96NL0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC3BQ96NL0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms