Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ6

ZFP3, Zinc finger protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP3Q96NJ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZFP3Q96NJ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFP3Q96NJ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFP3Q96NJ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms