Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC1Q96MU7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
YTHDC1Q96MU7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
YTHDC1Q96MU7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
YTHDC1Q96MU7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.6 ms