Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP57Q96MR6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP57Q96MR6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP57Q96MR6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP57Q96MR6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms