Protein–RNA interactions for Protein: Q96MC4

CEP295NL, CEP295 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295NLQ96MC4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP295NLQ96MC4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP295NLQ96MC4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP295NLQ96MC4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP295NLQ96MC4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms