Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX1

C4orf36, Uncharacterized protein C4orf36, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf36Q96KX1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf36Q96KX1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf36Q96KX1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf36Q96KX1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf36Q96KX1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf36Q96KX1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf36Q96KX1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf36Q96KX1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf36Q96KX1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf36Q96KX1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf36Q96KX1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms