Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX4I2Q96KJ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COX4I2Q96KJ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COX4I2Q96KJ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms