Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PGBD1Q96JS3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PGBD1Q96JS3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PGBD1Q96JS3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms