Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK5RAP3Q96JB5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK5RAP3Q96JB5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK5RAP3Q96JB5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms