Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPNQ96H22 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPNQ96H22 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms