Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BORCS6Q96GS4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
BORCS6Q96GS4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BORCS6Q96GS4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BORCS6Q96GS4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms