Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX8

PERP, p53 apoptosis effector related to PMP-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERPQ96FX8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PERPQ96FX8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PERPQ96FX8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PERPQ96FX8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PERPQ96FX8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PERPQ96FX8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PERPQ96FX8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PERPQ96FX8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PERPQ96FX8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PERPQ96FX8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PERPQ96FX8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PERPQ96FX8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PERPQ96FX8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PERPQ96FX8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PERPQ96FX8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PERPQ96FX8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PERPQ96FX8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PERPQ96FX8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PERPQ96FX8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PERPQ96FX8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PERPQ96FX8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms