Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIPA1Q96FS4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIPA1Q96FS4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1Q96FS4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms