Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX11Q96FC9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDX11Q96FC9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX11Q96FC9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX11Q96FC9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms