Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNFT2Q96EX2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195 ms