Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
C18orf8Q96DM3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C18orf8Q96DM3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C18orf8Q96DM3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms