Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMIGD2Q96BF3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMIGD2Q96BF3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMIGD2Q96BF3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMIGD2Q96BF3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms