Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN23Q96B33 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN23Q96B33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN23Q96B33 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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