Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NXPE3Q969Y0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NXPE3Q969Y0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXPE3Q969Y0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms