Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP4Q969X6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UTP4Q969X6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
UTP4Q969X6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UTP4Q969X6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms