Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNX21Q969T3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNX21Q969T3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SNX21Q969T3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNX21Q969T3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX21Q969T3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms