Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXT2Q93063 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
EXT2Q93063 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EXT2Q93063 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms