Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRN2Q92932 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRN2Q92932 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRN2Q92932 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRN2Q92932 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRN2Q92932 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRN2Q92932 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms