Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL2Q92772 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL2Q92772 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL2Q92772 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL2Q92772 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL2Q92772 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms