Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TNRQ92752 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TNRQ92752 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TNRQ92752 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TNRQ92752 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
TNRQ92752 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TNRQ92752 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TNRQ92752 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TNRQ92752 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TNRQ92752 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TNRQ92752 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TNRQ92752 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
TNRQ92752 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TNRQ92752 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TNRQ92752 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TNRQ92752 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TNRQ92752 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
TNRQ92752 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TNRQ92752 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TNRQ92752 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
TNRQ92752 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNRQ92752 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNRQ92752 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TNRQ92752 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TNRQ92752 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TNRQ92752 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TNRQ92752 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TNRQ92752 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TNRQ92752 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TNRQ92752 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TNRQ92752 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TNRQ92752 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TNRQ92752 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TNRQ92752 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TNRQ92752 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TNRQ92752 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TNRQ92752 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
TNRQ92752 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
TNRQ92752 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TNRQ92752 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TNRQ92752 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TNRQ92752 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TNRQ92752 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
TNRQ92752 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TNRQ92752 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TNRQ92752 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
TNRQ92752 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TNRQ92752 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TNRQ92752 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TNRQ92752 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TNRQ92752 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TNRQ92752 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TNRQ92752 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TNRQ92752 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TNRQ92752 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TNRQ92752 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TNRQ92752 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TNRQ92752 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TNRQ92752 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
TNRQ92752 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNRQ92752 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNRQ92752 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNRQ92752 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNRQ92752 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TNRQ92752 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TNRQ92752 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TNRQ92752 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TNRQ92752 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TNRQ92752 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TNRQ92752 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
TNRQ92752 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TNRQ92752 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TNRQ92752 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNRQ92752 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNRQ92752 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNRQ92752 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNRQ92752 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNRQ92752 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TNRQ92752 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TNRQ92752 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TNRQ92752 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TNRQ92752 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TNRQ92752 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TNRQ92752 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TNRQ92752 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TNRQ92752 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TNRQ92752 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TNRQ92752 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
TNRQ92752 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TNRQ92752 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TNRQ92752 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TNRQ92752 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TNRQ92752 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TNRQ92752 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TNRQ92752 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TNRQ92752 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TNRQ92752 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TNRQ92752 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TNRQ92752 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TNRQ92752 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms