Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC43.03■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
TOPBP1Q92547 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
TOPBP1Q92547 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
TOPBP1Q92547 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
TOPBP1Q92547 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
TOPBP1Q92547 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
TOPBP1Q92547 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
TOPBP1Q92547 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
TOPBP1Q92547 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
TOPBP1Q92547 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC42.89■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC42.89■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC42.88■■■■■ 4.46
TOPBP1Q92547 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
TOPBP1Q92547 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
TOPBP1Q92547 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
TOPBP1Q92547 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
TOPBP1Q92547 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
TOPBP1Q92547 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
TOPBP1Q92547 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
TOPBP1Q92547 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
TOPBP1Q92547 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
TOPBP1Q92547 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
TOPBP1Q92547 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
TOPBP1Q92547 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
TOPBP1Q92547 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
TOPBP1Q92547 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
TOPBP1Q92547 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC42.72■■■■■ 4.43
TOPBP1Q92547 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms