Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RGP1Q92546 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGP1Q92546 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGP1Q92546 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGP1Q92546 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms