Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SREK1Q8WXA9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREK1Q8WXA9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SREK1Q8WXA9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREK1Q8WXA9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREK1Q8WXA9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREK1Q8WXA9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREK1Q8WXA9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms