Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPBAR1Q8TDU6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPBAR1Q8TDU6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPBAR1Q8TDU6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms