Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGR3Q8TD06 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGR3Q8TD06 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGR3Q8TD06 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGR3Q8TD06 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1543.4 ms