Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC41

RNF217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF217Q8TC41 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF217Q8TC41 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF217Q8TC41 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF217Q8TC41 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF217Q8TC41 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF217Q8TC41 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF217Q8TC41 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF217Q8TC41 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF217Q8TC41 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF217Q8TC41 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF217Q8TC41 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF217Q8TC41 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF217Q8TC41 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF217Q8TC41 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF217Q8TC41 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms