Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA6DQ8NFY4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6DQ8NFY4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6DQ8NFY4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms