Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMIEQ8NEW7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMIEQ8NEW7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMIEQ8NEW7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMIEQ8NEW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMIEQ8NEW7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMIEQ8NEW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMIEQ8NEW7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
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