Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LINC00301Q8NCQ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LINC00301Q8NCQ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
LINC00301Q8NCQ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LINC00301Q8NCQ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms