Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCK3

ZNF485, Zinc finger protein 485, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF485Q8NCK3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF485Q8NCK3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF485Q8NCK3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF485Q8NCK3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF485Q8NCK3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF485Q8NCK3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF485Q8NCK3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF485Q8NCK3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF485Q8NCK3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF485Q8NCK3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF485Q8NCK3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms