Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TMEM229BQ8NBD8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM229BQ8NBD8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms